性爱娃娃 癌症免疫调养“水晶球”? iScience|科学家有望愚弄多模态特征来预计癌症患者承袭免疫疗法的恶果
转自:生物谷性爱娃娃
肿瘤的细胞和分子异质性是癌症免疫疗法濒临的一大挑战。近日,一篇发表在外洋杂志iScience上题为“Multimodalanalysisunveilstumormicroenvironmentheterogeneitylinkedtoimmuneactivityandevasion”的扣问阐明中,来自埃因霍温理工大学的扣问团队得手从肿瘤转录组学数据库中索求出独到的分子特征,这种特征被称为iHet,卤莽量化肿瘤微环境中的异质性着手,从而为深切承接患者对免疫疗法的响应并调动癌症调养提供了新念念路。
扣问者FrancescaFinotello博士暗意,肿瘤在细胞和分子层面透暴露权贵的异质性,这种各样性使得调养变得极其复杂。在本扣问中,扣问东谈主员开采出了iHet特征(iHetsignature),这一特征与多种癌症中的抗肿瘤免疫响应关系,并能匡助科学家精准预计患者对免疫疗法的响应。
连年来,免疫疗法在癌症调养中变得愈发垂危,它不是凯旋膺惩癌细胞,而是通过激活患者本人的免疫系统来抵抗癌症。然而,预计患者是否会对免疫疗法作出响应一直是个繁重,这是因为肿瘤微环境的高度异质性。为此,扣问东谈主员经受系统生物学的圭表来分析肿瘤微环境中的异质性。
在本扣问中,扣问东谈主员分析了进步1000名非小细胞肺癌患者的转录组学数据,愚弄多组学因子分析(MOFA)这一突出圭表,识别出肿瘤微环境中异质性的主要着手。通过分析这些样本,扣问东谈主员取得了可讲解的高等特征,揭示了存在的细胞类型、激活的转录因子和通路。然后,他们愚弄MOFA细目了肿瘤里面和肿瘤之间变化最大的特征,并从中推导出了iHet特征。
在线测速科学家有望愚弄多模态特征来预计癌症患者承袭免疫疗法的得手
进一步分析进步6000个患者的样本后,扣问东谈主员发现,这一特征在其他类型的癌症中也存在,况兼与癌症免疫响应凯旋联系。扣问的一个垂危方面是通过整合数字病理学数据来赞成潜在疗法得手的预计准确性,尤其是永别iHet特征中的“好”机制(复旧抗癌免疫活性的基础)和“坏”机制(看成肿瘤内的负反馈机制,保管免疫阻挠情状)。
除了预计患者的临床调养结局外,扣问的一个垂危孝顺在于特征的讲解,这为深切接洽决定免疫疗法得手或失败的身分提供了新路线,并有助于赞成调养圭表的临床恶果。
总之,这项扣问展示了若何整合转录组学数据来全面式样肿瘤微环境的表型异质性,并预计其在免疫检讨点阻断免疫疗法中的侥幸。
参考文件:
ÓscarLapuente-Santana,GregorSturm,JoanKant,etal.Multimodalanalysisunveilstumormicroenvironmentheterogeneitylinkedtoimmuneactivityandevasion,iScience(2024).DOI:10.1016/j.isci.2024.110529
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